El Yokohama FC volverá a disputar la J1 League este 2020 después de 13 años. El conjunto de la importante ciudad portuaria con el mismo nombre fue fundado en 1998 por hinchas del Flügels, quienes estaban enojados por la absorción de su club con el clásico rival. Esta desaparición sucedió a causa de errores administrativos de los dueños y la grave crisis financiera que sufrió el país nipón durante los 90´.

El antiguo Flügels fue establecido en 1964 en Yokohama por estudiantes y trabajadores. Al principio, el nombre del club fue Yokohama Sport Club. En 1979, la aerolínea All Nipón Airways (A.N.A) se convirtió en el máximo accionista del club y desde entonces fue modificando su nombre hasta llegar al ANA Yokohama. A partir de la creación de la Japan Professional Football League, fue elegido como uno de los diez equipos fundadores del primer torneo profesional y cambió su nombre a Yokohama Flügels.

Durante la década de los 90´, Japón sufrió una grave crisis económica que afectó a los clubes nipones que pagaban una importante cantidad de sueldos. Además, el interés en la J. League cayó junto a las asistencias en los estadios y las audiencias de televisión. El club más afectado con esta situación fue el Flügels. En 1998, La Corporación Sato Kogyo dejó de invertir dinero en el equipo, y A.N.A anunció la absorción del club al Yokohama Marinos, su clásico rival.

A partir de esta decisión, la mayoría de los hinchas del Flügels, quienes no estaban de acuerdo con la fusión, se organizaron para intentar salvar a la institución. Pero, a pesar de la movilización de los aficionados, la J. League aceptó la absorción. En el último partido de la historia del club, el 1 de enero de 1999, se consagró campeón de la Copa del Emperador tras derrotar 2-1 al Shimizu S.Pulse.

Unos días antes de la consagración, más concretamente el 25 de diciembre de 1998, los simpatizantes decidieron crear al Yokohama FC. Así, se convirtió en el primer equipo japonés en ser fundado y manejado por los aficionados. La nueva institución tuvo que cambiar su colores al celeste, ya que las rayas azul y blanco podían confundirse con las del Yokohama F. Marinos. Además, al escudo le agregaron un ave fénix como símbolo de la resurrección del Flügels.

La Japan Football League (JFL), la asociación que organiza el torneo amateur de Japón, aceptó la unión del Yokohama FC a la liga en marzo de 1999. Con Yasuhito Okudera, el primer japonés en jugar en Europa, como gerente y el alemán Pierre Littbarski, ex futbolista campeón del mundo con su selección, como director técnico, el club se consagró campeón ese mismo año y al siguiente de la JFL. A partir de esto, la J. League aceptó la membresía y comenzó a participar en la Segunda División.

El Yokohama FC contrató al histórico delantero japonés Kazuyoshi Miura, quien en aquel entonces tenía 38 años, en 2005. Este fichaje captó la atención de varios medios deportivos y de futbolistas experimentados, como Shōji Jō. Al año siguiente se consagró campeón de la J2 League y ascendió a la máxima categoría del fútbol japonés. Permaneció una temporada en la Primera División, ya qué descendió al terminar en la ultima posición con 16 puntos.

El conjunto de la ciudad portuaria logró su segundo ascenso a la J1 League el año pasado luego de terminar en el segundo lugar con 79 puntos, a cinco del Kashiwa Reysol, que terminó siendo el campeón del torneo. De esta forma, volverán a disputar la primera categoría del fútbol nipón después de 13 años. Tendrán como gran objetivo mantenerse en esta división a pesar de las grandes diferencias presupuestarias que hay con el resto de los equipos.

En la actualidad, el equipo cuenta con una gran cantidad de jugadores experimentados y juveniles. Su promedio de edad es de 27,89. En los futbolistas veteranos se destacan Miura, Shunsuke Nakamura, ex mediocampista de la Selección de Japón y del Celtic de Escocia, y el brasileño Leandro Domingues, mientras que en los jóvenes, Koki Saito, quien llego a disputar partidos con la Selección de Japón Sub 20 en el mundial de esa categoría.